軟體動物的食物價值很高，是很好的蛋白質來源，可食甪的軟體動物包括鮑魚､烏賊､螺､蜆､蟶子､蠔､蚌､青口等。

軟體動物可作為富營養的飼料，貝殼亦可磨成粉，作為家禽的鈣質補充劑，促進蛋殼的形成。

由於貝殼類動物，尤以瓣鰓類，是用過濾方法濾取水中食物，所以體內容易積聚污染物，例如細菌及重金屬。吃下受污染的貝類有中毒的危險。此外貝殼類動物亦可以傳染霍亂及甲形肝炎。

好些腹足類動物，如淡水螺是寄生蟲，例如枝睪吸蟲的中間宿主，因此吃下這些動物容易感染寄生蟲病。